MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum NY01_2001.047-5-1P chromosome

Total Repeats: 3135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018409	TTC	2	6	911508	911513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_018409	TAA	2	6	911521	911526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_018409	ATT	2	6	911530	911535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_018409	GAA	2	6	911564	911569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_018409	AAG	2	6	911586	911591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_018409	AGA	3	9	911660	911668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_018409	CTA	2	6	911709	911714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_018409	CAA	2	6	911734	911739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_018409	T	6	6	911743	911748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_018409	TTG	2	6	911752	911757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_018409	TCAT	2	8	911775	911782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_018409	TCT	2	6	911819	911824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_018409	TCAGAA	2	12	911826	911837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3014	NC_018409	T	6	6	911878	911883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_018409	AATCA	2	10	911917	911926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3016	NC_018409	TA	4	8	911935	911942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_018409	CAT	2	6	911953	911958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_018409	TTAT	2	8	912051	912058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_018409	TTA	2	6	912081	912086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_018409	T	6	6	912095	912100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_018409	ACCT	2	8	913961	913968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_018409	TA	6	12	913987	913998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_018409	TTA	2	6	914023	914028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_018409	TTTA	2	8	914927	914934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_018409	ATT	2	6	914980	914985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_018409	TA	3	6	914991	914996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_018409	TATT	2	8	915003	915010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_018409	ATT	2	6	916587	916592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_018409	T	6	6	916591	916596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_018409	ATA	2	6	919028	919033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_018409	T	6	6	919041	919046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_018409	CTT	2	6	919070	919075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_018409	A	6	6	919081	919086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_018409	GGT	2	6	919096	919101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_018409	ATT	2	6	919146	919151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_018409	TAA	2	6	919152	919157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_018409	AT	3	6	919638	919643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_018409	GAT	2	6	919654	919659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_018409	A	6	6	919670	919675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_018409	A	6	6	919677	919682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_018409	TA	3	6	919702	919707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_018409	AT	3	6	919712	919717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_018409	TTA	2	6	919789	919794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_018409	ATT	2	6	922226	922231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018409	AGA	2	6	922475	922480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_018409	AGA	2	6	922508	922513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_018409	ATA	2	6	922925	922930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_018409	TGTA	2	8	922952	922959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_018409	CTT	2	6	923151	923156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_018409	TTTG	2	8	923159	923166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_018409	ACA	2	6	923171	923176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_018409	T	6	6	923183	923188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_018409	CTTC	2	8	923258	923265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_018409	ATAGC	2	10	923270	923279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3055	NC_018409	CAT	2	6	923342	923347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_018409	TCCTT	2	10	923413	923422	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3057	NC_018409	TTA	2	6	923428	923433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_018409	TTG	2	6	923471	923476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_018409	TAA	2	6	923490	923495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_018409	CTT	2	6	923496	923501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_018409	T	8	8	923522	923529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_018409	TTA	2	6	923537	923542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_018409	A	6	6	923547	923552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_018409	AT	3	6	923582	923587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_018409	A	6	6	923614	923619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_018409	AATTT	2	10	923621	923630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_018409	A	8	8	925814	925821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_018409	T	7	7	925872	925878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_018409	ATT	2	6	925917	925922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_018409	A	7	7	926017	926023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_018409	TTA	2	6	926544	926549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_018409	ATT	3	9	926605	926613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_018409	TAA	2	6	929950	929955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_018409	A	7	7	929980	929986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_018409	ATT	2	6	930005	930010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_018409	TAA	2	6	930011	930016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_018409	A	7	7	932865	932871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_018409	TAA	2	6	932887	932892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_018409	TA	3	6	932918	932923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_018409	AAT	2	6	932924	932929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_018409	ATT	2	6	932940	932945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018409	CTAG	2	8	932968	932975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_018409	TGC	3	9	933094	933102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_018409	TGA	2	6	933127	933132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_018409	CAC	2	6	933153	933158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_018409	GTTG	2	8	933160	933167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_018409	CAT	2	6	933429	933434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_018409	TAA	2	6	933459	933464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_018409	CTT	3	9	933527	933535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_018409	CTT	2	6	933555	933560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_018409	ATC	2	6	933574	933579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_018409	AAT	2	6	935052	935057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_018409	ATA	2	6	937492	937497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_018409	AATCA	2	10	937569	937578	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3095	NC_018409	AT	3	6	937579	937584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_018409	TA	3	6	937589	937594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_018409	T	6	6	937615	937620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_018409	T	6	6	937622	937627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_018409	ATC	2	6	937638	937643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_018409	AT	3	6	937654	937659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018409	ACT	2	6	937746	937751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_018409	GAA	2	6	937791	937796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_018409	ATT	2	6	940653	940658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018409	AACTAA	2	12	942843	942854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3105	NC_018409	AT	3	6	942911	942916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018409	TAT	2	6	942920	942925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018409	AT	3	6	942924	942929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_018409	AGT	2	6	942974	942979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_018409	A	6	6	942999	943004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_018409	A	6	6	945119	945124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_018409	ATTA	2	8	945183	945190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_018409	A	6	6	946708	946713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_018409	T	6	6	946719	946724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018409	TAAA	2	8	946740	946747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_018409	TA	4	8	949604	949611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018409	TTAA	2	8	949615	949622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018409	TAAT	2	8	952548	952555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018409	ATAA	2	8	952581	952588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_018409	T	7	7	952628	952634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018409	A	6	6	952644	952649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018409	ATG	2	6	952664	952669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_018409	TAACC	2	10	952703	952712	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3123	NC_018409	CAAG	2	8	952724	952731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_018409	TTA	2	6	952758	952763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018409	ACCC	2	8	952776	952783	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3126	NC_018409	AAAC	2	8	952790	952797	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_018409	T	6	6	952856	952861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_018409	T	8	8	952865	952872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_018409	AT	3	6	952895	952900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_018409	T	6	6	957371	957376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_018409	TTA	2	6	963281	963286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_018409	T	6	6	963299	963304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_018409	TGC	2	6	963319	963324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_018409	TAT	2	6	963337	963342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_018409	AT	3	6	965507	965512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.